嵌入式软件 源代码保护

yangyang2822

操作系统： Debian+CF card(嵌入式)
Telnet禁止，ftp 禁止。仅开放几个端口，如123，产品本身使用的端口。
软件： 采用c编写，软件因为涉及到行业前沿技术，代码保密性要求较高。有部分是源代码，有部分是二进制文件，都不希望被获取。

产品是B/S结构，asp网页。
系统启动的时候顺序：linux-> Product 1-> Product 2->web
进入web以后是登录。然后使用产品，和后台文件有直接交互的是：
上传文件：仅允许2种格式到指定目录：xml,pem,名称任意，内容任意。
查看上传文件，可以check上传文件是否是正确的xml文件。（读取文件，仅检查是否包含标准xml文件头）
备份部分文件： 按照目录备份，多是xml文件，dat文件。一般都不是可执行文件。


现在，假设用户知道系统的目录结构。
想通过上传一些文件，让其自动执行或者被动的执行。破解telnet的禁止，ftp的禁止，查看到系统的部分程序代码。
或者修改backup下来的文件，然后再上传回去，导致其自动运行（破坏或者复制一些代码到能被备份下来的目录里面）。
但是restore的时候，只有名字正确的文件才可以被拷贝到指定目录。
请各位给点思路，或者有对linux比较精通的达人，给点解法～～～。

需要什么信息随时提供，具体的代码不能提供～